Son zamanlarda,Çin CDC Haftalık BülteniEkim 2025'te Sichuan eyaletinin Luzhou şehrindeki bir ilkokulda Grup C rotavirüsü (RVC) kaynaklı akut gastroenterit salgınının epidemiyolojik ve etiyolojik incelemesini anlatan önemli bir araştırma makalesi yayınlandı. Özellikle, Macro & Micro-Test'in yüksek verimli hedefli patojen yakalama kiti (prob-yakalama) ve tüm genom zenginleştirme dizileme teknolojisi, araştırmada çok önemli bir rol oynadı. Doğru patojen tanımlaması ve kapsamlı genomik karakterizasyon sağlayarak, bu teknoloji, salgının hızlı bir şekilde doğrulanması, kesin kaynak izleme ve etkili salgın kontrolü için kritik bilimsel kanıtlar sağladı.
Ani Salgın: Güneybatı Çin'de İlk RVC Salgını Bildirildi
15 Ekim 2025'te Luzhou'daki bir ilkokulda akut gastroenterit salgını meydana geldi. Okulda toplam 1943 öğrenci ve personel bulunmaktaydı ve 6'sı laboratuvar onaylı, 26'sı klinik olarak teşhis edilmiş olmak üzere toplam 32 vaka bildirildi; bu da %1,65'lik genel bir bulaşma oranına yol açtı. Salgın, 15 ve 16 Ekim tarihleri arasında zirve yaptı ve 7. sınıf, 5. kademede en yüksek bulaşma oranı (%23,08) görüldü. Hastaların çoğu okul çağındaki çocuklardı (ortalama yaş: 10 yıl) ve başlıca kusma (%65,62), ishal (%46,87) ve karın ağrısı (%37,50) şikayetleriyle başvurdular. Semptomlar genellikle 1-3 gün sürdü ve tüm hastalar ciddi komplikasyonlar olmadan iyileşti.
Epidemiyolojik inceleme, ilk vakanın 5. sınıfın 7. şubesinde okuyan 11 yaşında bir erkek çocuk olduğunu belirledi. Küçük kız kardeşi de ondan önce benzer semptomlar göstermişti; bu da ilk kaynağın ev içi bulaşma olduğunu düşündürmektedir. Kampüs içinde kusmukların yetersiz yönetimi (zamanında dezenfeksiyon veya alan izolasyonu yapılmadan doğrudan süpürme ve atma dahil) ve öğrenciler arasında yetersiz el hijyeni, muhtemelen bulaşmanın daha da artmasına yol açmıştır. Etkilenen sınıfların çoğu ikinci ve beşinci katlar arasında yer alıyordu ve bitişik erkek tuvaletlerini paylaşıyordu; bu da hem aerosol hem de temas yoluyla bulaşmanın yayılmaya katkıda bulunmuş olabileceğini göstermektedir.
Soruşturma özellikle zorlu hale geldi çünkü norovirüs ve A grubu rotavirüs testleri de dahil olmak üzere rutin patojen taramaları negatif sonuç verdi; bu da nadir görülen bir patojenin sorumlu olduğunu gösteriyordu.
Etiyolojik Tanı: Macro & Micro-Test'in Tüm Genom Dizilemesi Suçluyu Belirliyor
Norovirüs için yapılan ilk test negatif sonuç verdi. Luzhou CDC daha sonra, 8 virüs, 17 bakteri ve 3 parazit dahil olmak üzere 28 patojeni aynı anda tespit edebilen çoklu gastrointestinal patojen gerçek zamanlı PCR testi kullanarak sekiz klinik örneği taradı. 17 Ekim'de, altı örnekte Grup C rotavirüsü pozitif çıktı ve etken patojen başarıyla belirlendi.
Salgının kaynağını daha detaylı bir şekilde izlemek için araştırmacılar, beş pozitif örnek üzerinde hem nanopore metagenomik dizileme hem de Macro & Micro-Test'in prob yakalama yöntemiyle tüm genom zenginleştirme dizilemesi gerçekleştirdiler. Bu yaklaşım, beş adet eksiksiz RVC genom dizisi (SC01–SC05) elde etmeyi başardı. Hızlı multipleks PCR taraması ve ardından yüksek çözünürlüklü tüm genom dizilemesinin entegre stratejisi, doğru moleküler epidemiyoloji ve kaynak izleme için güçlü teknik destek sağladı.
Bilimsel Bulgular: Güneybatı Çin'de M2 Genotipinin İlk Kez Belirlenmesi
Araştırma ekibi, Macro & Micro-Test teknolojisi kullanılarak elde edilen yüksek kaliteli tüm genom verilerine dayanarak, çeşitli önemli bilimsel bulgular bildirdi:
Monoklonal salgının doğrulanması:Beş virüs izolatının tamamı, yalnızca 0-1 tek nükleotid polimorfizmi (SNP) farklılığıyla aynı tam genom genotipini (G4-P[2]-I2-R2-C2-M2-A2-N2-T2-E2-H2) paylaşıyordu ve bu da salgının tek bir bulaşma zincirinden kaynaklandığını kesin olarak gösteriyordu.
M2 genotipinin keşfi:Filogenetik analiz, Luzhou RVC suşlarının daha önce Çin RVC suşları arasında baskın olarak kabul edilen M3 genotipinden ziyade M2 genotipine ait olduğunu ortaya koymuştur. Bu bulgu, Çin'deki RVC genotip dağılımına ilişkin geleneksel anlayışı sorgulamakta ve güneybatı Çin'de M2 genotipinin ortaya çıkışını doğrulamaktadır.
Uluslararası bulaşma bağlantılarına dair kanıtlar:Tüm genom karşılaştırması, Luzhou suşları ile daha önce Yunnan'da (2025), Rusya'nın Novosibirsk kentinde (2017) ve İtalya'da (2012) bildirilen RVC suşları arasında yüksek genetik benzerlik olduğunu göstererek, aktif bir Avrasya bulaşma ağının varlığını düşündürmektedir.
Önleme ve Kontrol Açısından Çıkarımlar: Erken Teşhis ve Hızlı Müdahale Esastır
Patojenin tanımlanmasının ardından, Luzhou Hastalık Kontrol ve Önleme Merkezi (CDC) derhal kapsamlı kontrol önlemleri uygulamaya koydu; bu önlemler arasında vaka izolasyonu, çevresel dezenfeksiyon, standartlaştırılmış kusmuk yönetimi ve geçici ders askıya alma yer alıyordu. Salgın, tek bir kuluçka dönemi içinde başarıyla kontrol altına alındı ve 21 Ekim'den sonra ek vaka bildirilmedi.
Bu araştırma aynı zamanda önemli bir halk sağlığı dersi de veriyor: A grubu rotavirüs ve norovirüs testlerinin her ikisinde de negatif sonuç veren kümelenmiş gastroenterit salgınlarında, C grubu rotavirüs ve diğer A grubu dışı rotavirüsler rutin tanı taramasına dahil edilmelidir.
Bu çalışma, Çin'in güneybatısında bildirilen ilk C grubu rotavirüs salgınını ve bölgede M2 genotipinin ilk tanımlanmasını temsil ederek, Doğu Asya'daki RVC epidemiyolojisine ilişkin mevcut anlayışı genişletmektedir. Bu araştırmada, Macro & Micro-Test'in çoklu PCR taramasını tüm genom zenginleştirme dizilemesiyle birleştiren entegre çözümü, hem hızlı patojen tanımlamasını hem de yüksek çözünürlüklü moleküler kaynak izlemesini sağlayarak önemli pratik değer göstermiş ve gelecekteki bulaşıcı hastalık salgınlarının hassas bir şekilde araştırılması ve kontrolü için tekrarlanabilir bir teknik çerçeve sunmuştur.
Yayın tarihi: 30 Temmuz 2026