— Zhejiang CDC, Macro & Micro-Test ve Çin CDC'nin ortak çalışması Frontiers in Cellular and Infection Microbiology dergisinde yayınlandı.
Çalışmaya Genel Bakış
Mayıs 2026'da Frontiers in Cellular and Infection Microbiology (JCR Q1, IF ≈ 4.6) dergisinde, Zhejiang Eyaleti Hastalık Kontrol ve Önleme Merkezi (Zhejiang CDC) liderliğinde, Pekin Macro & Micro-Test Bio-Tech Co., Ltd.'nin biyoinformatik ekibi ve Ulusal Bulaşıcı Hastalık Kontrol ve Önleme Enstitüsü'nün (Çin CDC) ortak yazarlığıyla hazırlanan bir makale yayınlandı. Çalışmanın başlığı şöyledir:
“Çin'in Zhejiang bölgesinde bulunan yedi Brucella abortus suşunun tanımlanması ve filogenetik analizi.”
Bu çalışma, Çin'in Zhejiang eyaletinde Brucella abortus'un (B. abortus) ilk sistematik, tüm genom tabanlı filogenetik izlenebilirlik analizini temsil etmektedir. Ekip, 2015-2025 yılları arasında toplanan yedi izolatı (Jinhua, Quzhou ve Ningbo'dan dört insan kökenli ve üç sığır kökenli suş) analiz etti. Bulgular, bu "kuzeyde baskın tür"ün, Çin'in doğusundaki atipik bir güney salgın bölgesindeki kökeni ve bulaşma yolları için genomik kanıtlar sağlamaktadır.
Arka Plan ve Önemi
Bruselloz, Brucella cinsi bakterilerin neden olduğu zoonotik bir hastalıktır. Brucella abortus öncelikle sığırları enfekte eder, ancak insanlarda da hastalığa neden olabilir. Çin'de bruselloz belirgin coğrafi farklılıklar göstermektedir: En yüksek vaka sayısı kuzey illerinde (örneğin İç Moğolistan, Shanxi, Heilongjiang) görülmektedir. Buna karşılık, Zhejiang dahil olmak üzere güney illerinde tarihsel olarak Brucella melitensis baskın olmuştur ve B. abortus vakaları çok az bildirilmiştir. Bu bölgesel farklılık, Zhejiang'da B. abortus'un genetik karakterizasyonunu ve kaynak izlemesini önemli bir halk sağlığı önceliği haline getirmektedir.
Yöntemler ve Temel Bulgular
Araştırma ekibi, moleküler biyoloji ve biyoinformatik alanlarını birleştiren çok yönlü bir strateji benimsedi:
1.Patojen tanımlama ve temel tipleme
BCSP-31 geni PCR ve AMOS-PCR, yedi izolatın tamamının B. abortus olduğunu doğruladı.
Dokuz temel gen üzerinden yapılan çoklu lokuslu sekans tiplemesi (MLST), tüm izolatların ST2 sekans tipine ait olduğunu ortaya koyarak, Zhejiang'da dolaşan B. abortus suşları arasında yüksek genetik homojenlik olduğunu göstermiştir.
2.Tüm genom karakterizasyonu
Tüm genom dizilemesi Illumina NovaSeq platformunda gerçekleştirildi. Ortalama nükleotid özdeşliği (ANI) analizi, Zhejiang izolatlarının referans suşu B. abortus 544 ile %99,99'a kadar benzerlik gösterdiğini ortaya koydu.
Tüm genomun analizi, oldukça korunmuş bir popülasyonu ortaya çıkardı: 3.084 çekirdek geni tanımlandı, sadece 10 kabuk geni bulundu ve yumuşak çekirdek veya bulut genlerine rastlanmadı.
3.Virülans ve antimikrobiyal direnç geni profilleri
Toplam 68 virülansla ilgili faktör tahmin edildi; bunlar arasında LPS biyosentezi, T4SS salgı sistemi ve BvrR-BvrS iki bileşenli düzenleyici sistem gibi klasik yollar yer almaktadır. Özellikle, tüm izolatlar bmaA ve btaF adezyon genlerinden yoksundu. Direnç geni analizi, CARD veritabanında yalnızca mprF genini tespit etti ve başka hiçbir direnç belirleyicisi tanımlanmadı.
4. Filogenetik yeniden yapılandırma ve aktarım izleme
Çekirdek genom tek nükleotid polimorfizmi (cgSNP) analizi, Zhejiang izolatlarını küresel filogenetik ağaçta belirli bir konuma yerleştirdi. Sonuçlar, Zhejiang suşlarının Rusya, Moğolistan ve Çin'in kuzeyindeki çeşitli eyaletlerden (Ningxia, Heilongjiang, İç Moğolistan, Hebei, Gansu, Pekin) gelen suşlarla birlikte monofiletik bir grup oluşturduğunu gösterdi. Bu grup ayrıca üç farklı alt klada (Klad 1-3) ayrılıyor ve bu da birden fazla bağımsız giriş olayını düşündürüyor.
Sonuçlar ve Çıkarımlar
Bu çalışma, Zhejiang Eyaleti'ndeki B. abortus'a ait ilk yüksek hassasiyetli genomik veri setini sunmakta ve çeşitli önemli sonuçlar ortaya koymaktadır:
- Clear genetik arka plan– Zhejiang'da dolaşan B. abortus suşları ST2'ye aittir, genomik olarak oldukça korunmuştur ve tipik bir sığır brusellozu soyunu temsil etmektedir.
2. Evibölgeler arası bulaşmanın yoğunluğu– Filogenetik analiz, Zhejiang'da bağımsız bir endemik soyun varlığını desteklememektedir. Bunun yerine, veriler bu suşların kuzey Çin'den kaynaklandığını ve Rusya ve Moğolistan'daki suşlarla ortak bir evrimsel geçmişe sahip olabileceğini güçlü bir şekilde göstermektedir. Üç alt kladın varlığı, birden fazla ayrı giriş olayını ima etmektedir.
3. Halk sağlığı üzerindeki etkileri– Bulgular, Zhejiang gibi geleneksel olarak endemik olmayan bölgelerde bile bruselloz için genomik gözetimin değerini vurgulamaktadır. Mevcut vaka sayısı düşük olsa da, cgSNP gibi yüksek çözünürlüklü araçlar, ithal salgınların kaynağını etkili bir şekilde izleyebilir ve iller arası hayvancılık taşımacılığıyla ilişkili bulaşma zincirlerini kesmek için bilimsel kanıt sağlayabilir.
Bu çalışma, Zhejiang eyaletindeki bir araştırma açığını kapatmakla kalmayıp, Yangtze Nehri Deltası bölgesinde bruselloz patojen gözetimi ve risk değerlendirmesi için yeni temel veriler de sağlamaktadır.
Makale Bilgileri:
Yang, Y., Shi, X., Chen, J., Wang, L., Wu, Z., Yao, W., … & Wu, B. (2026). Çin'in Zhejiang bölgesinde yedi Brucella abortus suşunun tanımlanması ve filogenetik analizi. Hücresel ve Enfeksiyon Mikrobiyolojisi Alanındaki Sınırlar, 16, 1758965.
Yayın tarihi: 10 Haz-2026