Yakın zamanda yapılan bir metagenomik çalışma, Heilongjiang eyaletindeki kemirgenler tarafından taşınan Lassa virüsü, Amur virüsü, Salmonella ve Yersinia pestis de dahil olmak üzere oldukça çeşitli virüs ve bakteri spektrumunu ortaya çıkardı.
Araştırmada şu yöntemler kullanıldı:Macro & Micro-Test'ten Patojen RNA Zenginleştirme KitiBu yöntem, prob yakalama teknolojisine dayanmaktadır. Konakçı rRNA'sını ve diğer korunmuş konakçı parçalarını seçici olarak azaltarak, mikrobiyal RNA'yı etkili bir şekilde korur ve patojen tespit hassasiyetini önemli ölçüde artırır. Bu patojen RNA zenginleştirme adımı, yüksek bir tespit oranına ulaşmada kritik öneme sahipti ve patojen gözetimi için güçlü bir teknik destek sağladı.
Kemirgenler: Zoonotik Hastalıkların Başlıca Rezervuarları
Kemirgenler, dünya çapında 2.000'den fazla türüyle ve tüm memeli türlerinin %40'ından fazlasını oluşturarak, memelilerin en çok tür içeren ve en yaygın dağılıma sahip grubudur.
Ekolojik önemlerinin ötesinde, kemirgenler çok sayıda zoonotik patojenin başlıca rezervuarı ve taşıyıcısı olarak görev yapmaktadır.Kemirgenlerin yaşam alanları sıklıkla insan ortamlarıyla örtüştüğü için (doğrudan ısırıklar, dışkıyla temas veya pire ve akarlar yoluyla dolaylı bulaşma yoluyla), barındırdıkları patojenler sürekli bir halk sağlığı tehdidi oluşturmaktadır.
Dikkat çekici bir şekilde, ortaya çıkan bulaşıcı hastalıkların %70'inden fazlası vahşi yaşamdan kaynaklanmaktadır ve kemirgenler en önemli virüs rezervuarlarından birini oluşturmaktadır.
Heilongjiang Sınır Bölgesi: Patojen Gözetimi İçin Bir Cephe Hattı
Çin'in kuzeydoğusundaki sınır eyaleti Heilongjiang, zengin ekolojik kaynaklara sahip olup birçok ülkeyle sınır komşusudur. Zengin biyoçeşitlilik ve sık sınır ötesi nüfus hareketinin birleşimi, patojenlerin bulaşması için elverişli koşullar yaratmaktadır.
Haziran ve Temmuz 2021 tarihleri arasında araştırmacılar, Mudanjiang şehrinin Hengdaohezi kasabasından 67 adet yabani kemirgen topladı. Örnekler şunları içeriyordu:
l 20Apodemus yarımadası
l 47Myodes rufocanus
Tüm örnekler yerleşim alanlarında ve çevredeki tarım arazilerinde yakalanmıştır; bu da insan yerleşimleri ile vahşi yaşam alanları arasındaki yakın etkileşimi vurgulamaktadır.
Patojen Zenginleştirme Teknolojisi: Konakçı Ortamındaki Girişimlerin Üstesinden Gelme
Metagenomik dizilemede, konakçı RNA'sı genellikle dizileme okumalarında baskın rol oynar ve düşük miktardaki patojen sinyallerini maskeler.
Bu zorluğun üstesinden gelmek için çalışmada şu yöntem kullanıldı:Macro & Micro-Test'in Patojen Metagenomik Tespit Kiti. Prob yakalama teknolojisi kullanılarak, özel olarak tasarlanmış problar konakçı rRNA'ya ve korunmuş dizilere bağlanır, bu da bunların tükenmesini ve dolayısıyla mikrobiyal RNA'nın zenginleştirilmesini sağlar.
Bu yaklaşım, patojen tespit hassasiyetini önemli ölçüde artırarak, sonraki aşama sekanslama işlemlerinin daha yüksek oranda patojen okuması elde etmesini sağladı. Zenginleştirme adımı, kemirgenler tarafından taşınan patojen spektrumunun doğru bir şekilde karakterize edilmesi için sağlam bir temel oluşturdu.
Zenginleştirme işleminden sonra, RNA örnekleri ters transkripsiyon, kütüphane oluşturma ve yüksek verimli dizileme işlemlerine tabi tutuldu. Biyoinformatik analiz şunları içeriyordu:
Konak genomu filtreleme
Kraken2 kullanılarak taksonomik sınıflandırma
Eğrelti otuyla aşırı miktardaki bitkinin düzeltilmesi
Bu iş akışı, virüs ve bakteri topluluklarının kapsamlı bir profilini oluşturdu.
Araştırma Bulguları: Birden Çok Virüs ve Bakterinin Birlikte Dolaşımı
Viral Bulgular
Tespit edilen virüsler, 21 farklı virüs ailesine aitti; bunlar arasında şunlar yer almaktadır:ArenaviridaeVeHantaviridae.
Başından sonuna kadaryeniMegahit kullanılarak yapılan derleme sonucunda 154 viral kontig oluşturuldu ve bunların 110'u sekiz farklı aileden 19 virüsle eşleşti.
In Apodemus yarımadasıAşağıdaki virüsler tespit edilmiştir:
l Arenavirüsler: Lassa virüsü, Wenzhou virüsü, Gairo virüsü
l Hantavirüsler: Amur virüsü, Puumala virüsü
In Myodes rufocanusSıçan arterivirüsü ve Amur virüsü tespit edildi.
Bu patojenler arasında şunlar yer almaktadır:
Lassa virüsü, yaklaşık %20'ye varan ölüm oranlarıyla seyreden viral hemorajik ateşin etken maddesidir.
Amur virüsü, böbrek sendromlu hemorajik ateşe (HFRS) neden olan patojenlerden biridir. Çin, hantavirüs enfeksiyonlarının küresel olarak en yüksek yükünü bildirmektedir.
Bakteriyel Bulgular
Toplam 1.051 bakteri cinsi tanımlandı.
En bol bulunan cinsler şunlardı:
lSalmonella(26–31%)
lYersinia(11–23%)
SalmonellaTifo, gıda kaynaklı önemli bir patojen olup, dünya çapında yılda tahminen 9 milyon tifo vakasına ve yaklaşık 110.000 ölüme neden olmaktadır.
Yersinia pestisVeba hastalığının etken maddesi olan bakteri, tarihte üç büyük salgına neden olmuştur. Heilongjiang eyaleti, Çin'in doğal veba odaklarından biri olarak kabul edilmekte ve veba gözetimi için öncelikli bir bölge olmaya devam etmektedir.
Çalışmanın Önemi
Bilimsel Katkılar
Bu çalışma, Heilongjiang'daki kemirgenlerde Lassa virüsü parçaları ve sıçan arterit virüsünün ilk raporunu oluşturarak Çin'in kemirgen kaynaklı patojen veri tabanını genişletmektedir.
Bu yöntem, yerel kemirgen popülasyonlarındaki virüs ve bakteri topluluklarını sistematik olarak karakterize ederek, sınır bölgelerindeki zoonotik hastalıkların gözetimi için temel veriler sağlar.
Halk Sağlığı Açısından Etkileri
Bulgular, sürekli gözetim ve patojen taramasının gerekliliğini vurgulamaktadır.A. yarımadalarıVeM. rufocanus.
Veriler, veba ve böbrek sendromlu hemorajik ateş gibi hastalıklar için kaynak kontrol stratejilerini destekleyen bilimsel kanıtlar sunmaktadır.
Metodolojik Güçlü Yönler
Metagenomik dizileme, hem bilinen hem de yeni patojenlerin tarafsız bir şekilde tespit edilmesini sağlar.
Bu çalışmada, Macro & Micro-Test'in patojen zenginleştirme teknolojisi, karmaşık biyolojik örneklerde hedef patojen tespitini etkili bir şekilde artırarak güçlü bir performans sergilemiştir. Sonuçlar, vahşi yaşam gözetiminde yüksek hassasiyetli patojen tanımlamasını destekleme yeteneğini doğrulamaktadır.
Ürün Önerisi
Bu çalışmada başarılı bir şekilde uygulanması göz önüne alındığında, Makro ve Mikro Test Patojen RNA Zenginleştirme Kiti, metagenomik gözetim araştırmaları için şiddetle tavsiye edilmektedir.
Kit, konakçı nükleik asitlerini verimli bir şekilde tüketerek ve mikrobiyal sekansları zenginleştirerek, tespit hassasiyetini ve veri kalitesini önemli ölçüde iyileştirir. Karmaşık örneklerde doğru patojen tespiti için temel bir araçtır ve halk sağlığı gözetimi, zoonotik risk değerlendirmesi ve salgın hazırlığı için güçlü teknik destek sağlar.
Contact to learn more: marketing@mmtest.com
Yayın tarihi: 02 Mart 2026